雍和宫在康熙三十三年(1694)始建,初为雍雍和宫亲王府。雍正即位后,将其中的一半改为黄教上院,另一半作为行宫,后行宫为火所焚,
遂于雍正三年(1725)年将上院改为行宫,称“雍和宫”。
乾隆九年(1744),雍和宫改作正式的藏传佛教的寺庙,并成为清政府掌管全国藏传佛教事务的中心。
解放后,政府于1950年、1952年、1979年,进行全面修整,并于1961年公布为全国重点文物保护单位。
1981年对外开放雍和宫。
1957年10月北京市人民委员会公布了包括雍和宫在内的北京市第一批39个文物保护单位。
1961年3月,雍和宫被国务院列为全国第一批国家重点文物保护单位。
2013年,灵丹真朱砂成为北京雍和宫特约供应商